RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM123Q8N131 208 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF128Q8TEB7 428 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ISYNA1Q9NPH2 558 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 AQP7O14520 342 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 WISP2O76076 250 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNGR4O95473 234 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SSX6Q7RTT6 188 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC20BQ86Y33 519 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 RFLNBQ8N5W9 214 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ISOC1Q96CN7 298 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 INTS14Q96SY0 518 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 YIPF3Q9GZM5 350 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR76Q9H967 626 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 COPS3Q9UNS2 423 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 RCE1Q9Y256 329 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MGAQ8IWI9 3026 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CD36P16671 472 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS6P49758 472 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 TMBIM6P55061 237 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSM1Q08AH1 577 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD3Q8WU67 409 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM54Q969K7 222 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MCHR2Q969V1 340 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXN4Q96NZ1 517 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 DOK1Q99704 481 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDM14Q9GZV8 571 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMK2AQ9UQM7 478 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC13O75165 2243 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-DQA2P01906 255 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 NR2C1P13056 603 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SELENOPP49908 381 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 HSF2Q03933 536 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 TSTQ16762 297 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC26A10Q8NG04 563 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MNTQ99583 582 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 GLTPQ9NZD2 209 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ENPP5Q9UJA9 477 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 GAAP10253 952 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 NTF4P34130 210 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CSNK1A1P48729 337 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 LRFN4Q6PJG9 635 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CHMP1BQ7LBR1 199 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6N2Q8NGY6 317 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FNDC9Q8TBE3 224 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 NSMAFQ92636 917 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL9Q9P2J3 617 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CCRL2O00421 344 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LALBAP00709 142 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 QDPRP09417 244 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 SSX1Q16384 188 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CDONQ4KMG0 1287 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PLXDC2Q6UX71 529 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 DPY19L4Q7Z388 723 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RY8Q86VZ1 359 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 GLB1L2Q8IW92 636 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB2BQ8WUD1 216 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PNPLA2Q96AD5 504 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM45BQ96B21 275 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNA1AO00555 2505 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 AQP8O94778 261 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MPZL1O95297 269 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 HRGP04196 525 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PSKH1P11801 424 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CPEP16870 476 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTA2P62736 377 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTG2P63267 376 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CNPY1Q3B7I2 92 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PHYHD1Q5SRE7 291 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 C20orf196Q8IYI0 205 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 SYS1Q8N2H4 156 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6N1Q8NGY5 312 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 C4orf36Q96KX1 117 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRG4Q9BZD6 226 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF122Q9H9V4 155 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 BABAM2Q9NXR7 383 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa22.06■■□□□ 1.12
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