RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	COMTD1	Q86VU5	262 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAP6	Q96JE9	813 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SRR	Q9GZT4	340 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SSR3	Q9UNL2	185 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A0G2JNJ9	132 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	HMGN4	O00479	90 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAAH	O00519	579 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SCD	O00767	359 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	UGT2B17	O75795	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	NTN1	O95631	604 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	GLI4	P10075	376 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SFTPD	P35247	375 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	P2RX3	P56373	397 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF117	Q03924	483 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	FOXF2	Q12947	444 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MARC2	Q969Z3	335 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SARAF	Q96BY9	339 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ABCB9	Q9NP78	766 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882		Q9UFV3	132 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPATA2	Q9UM82	520 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR2M5	A3KFT3	312 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	AQP7	O14520	342 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	RGS13	O14921	159 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SUSD5	O60279	629 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	HPN	P05981	417 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PTN	P21246	168 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MLC1	Q15049	377 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	VASN	Q6EMK4	673 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	NTM	Q9P121	344 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CMAHP	Q9Y471	501 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SHC1	P29353	583 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLDN15	P56746	228 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRR1	Q96L50	414 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MTOR	P42345	2549 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MEIOC	A2RUB1	952 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882		E9PLN8	166 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADAM11	O75078	769 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TGM6	O95932	706 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SYT14P1	Q58G82	188 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SYT14	Q8NB59	555 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PINK1	Q9BXM7	581 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		11.22	□□□□□ -0.61

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