RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TO15178 435 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TK1P04183 234 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 QDPRP09417 244 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 NDUFB7P17568 137 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 AMY2BP19961 511 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 STOMP27105 288 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TAS2R31P59538 309 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 FXNQ16595 210 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 MICBQ29980 383 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 LPCAT4Q643R3 524 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 DRAM2Q6UX65 266 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SYT9Q86SS6 491 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 VRK2Q86Y07 508 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 LINC00346Q8IVM7 164 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 PRSS33Q8NF86 280 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ZFAND1Q8TCF1 268 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ERGIC1Q969X5 290 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 GON7Q9BXV9 100 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ASB4Q9Y574 426 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 FOXH1O75593 365 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ACHEP22303 614 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SDHAP31040 664 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 CD96P40200 585 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 IL18Q14116 193 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 PLA2G2CQ5R387 149 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 CCNJQ5T5M9 372 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM205Q6UW68 189 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SPATC1Q76KD6 591 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 OR4K15Q8NH41 348 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ARSGQ96EG1 525 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 GPR137Q96N19 417 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TBX5Q99593 518 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 EBF4Q9BQW3 602 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 KLK4Q9Y5K2 254 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF724A8MTY0 619 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 C9JVG2 144 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 H3BSA7 217 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 K7ENP7 123 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 M0R082 166 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 AKR7A3O95154 331 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 GNRHRP30968 328 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 FOXF1Q12946 379 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 GNMTQ14749 295 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SYPL1Q16563 259 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 CCSMST1Q4G0I0 132 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 RABL3Q5HYI8 236 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SLC16A9Q7RTY1 509 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SULF2Q8IWU5 870 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 OR7G2Q8NG99 324 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 CMTM3Q96MX0 182 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 GLTPQ9NZD2 209 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TCHHQ07283 1943 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 A0A1B0GTH9 108 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 B9A039 149 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 NRASP01111 189 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 OR1E2P47887 323 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 C4orf17Q53FE4 359 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 CLVS2Q5SYC1 327 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 FAM131AQ6UXB0 335 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 FAM57BQ71RH2 274 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 LINGO2Q7L985 606 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SSX6Q7RTT6 188 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SPRED2Q7Z698 418 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms