RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TMEM54Q969K7 222 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ZNF566Q969W8 418 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 UPRTQ96BW1 309 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TMEM19Q96HH6 336 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PPP1R36Q96LQ0 422 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 OR52E6Q96RD3 313 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ZBTB18Q99592 522 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 NOX4Q9NPH5 578 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TMEM38BQ9NVV0 291 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 A0A1B0GWA3 101 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 DHHO43323 396 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SERPINI2O75830 405 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 OR6A2O95222 327 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TGDSO95455 350 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ANP32DO95626 131 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MT-ATP6P00846 226 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 C1QCP02747 245 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 BGLAPP02818 100 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SHBGP04278 402 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ETFAP13804 333 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TNFRSF1AP19438 455 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TNFSF4P23510 183 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CDKN2CP42773 168 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ZNF84P51523 738 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 BIDP55957 195 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HSF2Q03933 536 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ASPHD2Q6ICH7 369 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ZER1Q7Z7L7 766 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 C1QL4Q86Z23 238 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 C10orf53Q8N6V4 93 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HIPK4Q8NE63 616 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 OR4K5Q8NGD3 323 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SH3GL3Q99963 347 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PRDM13Q9H4Q3 707 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 NPHS2Q9NP85 383 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TMEM106BQ9NUM4 274 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 C1RLQ9NZP8 487 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CHST2Q9Y4C5 530 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 RNF114Q9Y508 228 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 POMT1Q9Y6A1 747 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TRAV40A0A0B4J280 105 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 F5H0A9 414 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 C3orf80F5H4A9 247 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PLPP3O14495 311 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PIN1P1O15428 100 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 FAM153BP0C7A2 387 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ADORA3P0DMS8 318 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SELEP16581 610 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CCNOP22674 350 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PRKAR1BP31321 381 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MDH2P40926 338 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 BTG1P62324 171 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HOXC5Q00444 222 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 C2orf68Q2NKX9 166 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 THEM4Q5T1C6 240 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 NHLRC1Q6VVB1 395 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC35D2Q76EJ3 337 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 REC114Q7Z4M0 266 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ZNF283Q8N7M2 679 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 OR5J2Q8NH18 312 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 BBS10Q8TAM1 723 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TMEM27Q9HBJ8 222 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 BCL2L10Q9HD36 194 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC17A7Q9P2U7 560 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 C5orf58C9J3I9 102 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 C11orf98E9PRG8 122 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 BPGMP07738 259 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 ZCCHC18P0CG32 403 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 CD80P33681 288 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 MVDP53602 400 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 TTMPQ5BVD1 217 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 GPR157Q5UAW9 335 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 OGFOD2Q6N063 350 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-228ENST00000551473 WDR88Q6ZMY6 472 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms