RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 DOK3Q7L591 496 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ZNF627Q7L945 461 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 REC114Q7Z4M0 266 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CARM1Q86X55 608 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 OR4M2Q8NGB6 313 aa7.24□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 OR5J2Q8NH18 312 aa7.24□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 ZNF566Q969W8 418 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.24□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.24□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 GLTPQ9NZD2 209 aa7.24□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 A0A1B0GX12 115 aa7.23□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 CLDN34H7C241 214 aa7.23□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TPST1O60507 370 aa7.23□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 PRSS23O95084 383 aa7.23□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 FAM157BP0CG42 384 aa7.23□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 LMO4P61968 165 aa7.23□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 MSMPQ1L6U9 139 aa7.23□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 HFEQ30201 348 aa7.23□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.23□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.23□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 RETREG3Q86VR2 466 aa7.23□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 OR52B2Q96RD2 323 aa7.23□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MCHR1Q99705 422 aa7.23□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 OR51B6Q9H340 312 aa7.23□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.23□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 NANSQ9NR45 359 aa7.23□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 PLSCR5A0PG75 271 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MCIDASD6RGH6 385 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 LRRN3E7EW58 273 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 WNT9BO14905 357 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 DHHO43323 396 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 PLPP2O43688 288 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MGRN1O60291 552 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 FMO6PO60774 539 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 NCR1O76036 304 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CH25HO95992 272 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CLPTM1O96005 669 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 AVPP01185 164 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 IGHG1P01857 330 aa7.22□□□□□ -1.25
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TROAP-208ENST00000548817 UMPSP11172 480 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 GATA3P23771 443 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 AQP1P29972 269 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CRYBB2P43320 205 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MAGEB1P43366 347 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 UCP2P55851 309 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC3A1Q07837 685 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 FAM209AQ5JX71 171 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.22□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 AVPI1Q5T686 147 aa7.22□□□□□ -1.25
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