RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 CDH15P55291 814 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 LRFN4Q6PJG9 635 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 LYPD4Q6UWN0 246 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM214BQ7L5A3 538 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 ZBTB46Q86UZ6 589 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF511Q8NB15 262 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 SEC61A2Q9H9S3 476 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 UPB1Q9UBR1 384 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 COL6A6A6NMZ7 2263 aa23.44■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 A0A1W2PPL8 197 aa23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 CENPBD1B2RD01 187 aa23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 CASP6P55212 293 aa23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 HIST3H3Q16695 136 aa23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 KLHL22Q53GT1 634 aa23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 OTPQ5XKR4 325 aa23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 EFCAB10A6NFE3 127 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 GLO1Q04760 184 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 ST3GAL4Q11206 333 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 FOXF2Q12947 444 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TSPO2Q5TGU0 170 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 OR4F15Q8NGB8 312 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 MYDGFQ969H8 173 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 LGALS12Q96DT0 336 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TTYH2Q9BSA4 534 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 CRLF2Q9HC73 371 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 ERVK-18Q9QC07 812 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 EPG5Q9HCE0 2579 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 DOCK7Q96N67 2140 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 STSP08842 583 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 PMPCAQ10713 525 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 RACGAP1Q9H0H5 632 aa23.42■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TOXO94900 526 aa23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC35A2P78381 396 aa23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 KCTD21Q4G0X4 260 aa23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 LINC01590Q5TEZ4 76 aa23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC7A10Q9NS82 523 aa23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa23.41■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 MPZL1O95297 269 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 CDAP32320 146 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 MVKQ03426 396 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 RAB40BQ12829 278 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TMED1Q13445 227 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TSPAN14Q8NG11 270 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TBX5Q99593 518 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF696Q9H7X3 374 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 PRSS50Q9UI38 385 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 OSGIN2Q9Y236 505 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 DHHO43323 396 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 RGS10O43665 173 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 SELENOFO60613 162 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 FADS2O95864 444 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 GLI4P10075 376 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TIMP3P35625 211 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC15A1P46059 708 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF84P51523 738 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 VWA1Q6PCB0 445 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 GLB1L2Q8IW92 636 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 OR52I1Q8NGK6 324 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 HTRA1Q92743 480 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM80Q96HE8 168 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 DUSP21Q9H596 190 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 SHANK1Q9Y566 2161 aa23.4■■□□□ 1.34
NDUFS3-211ENST00000533507 OR6C65A6NJZ3 312 aa23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 ATP6V1B1P15313 513 aa23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 GABARAPL2P60520 117 aa23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 FAPQ12884 760 aa23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 MEP1BQ16820 701 aa23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 C9orf135Q5VTT2 229 aa23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 POMGNT2Q8NAT1 580 aa23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 OR10H4Q8NGA5 316 aa23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 ADGRL4Q9HBW9 690 aa23.39■■□□□ 1.33
NDUFS3-211ENST00000533507 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms