RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511313.5

POLR2J3-215, Transcript of RNA polymerase II subunit J3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR2J3, Length 4,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3-215ENST00000511313 GPR148Q8TDV2 347 aa8.66□□□□□ -1.02
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POLR2J3-215ENST00000511313 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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POLR2J3-215ENST00000511313 LRP5LA4QPB2 252 aa8.66□□□□□ -1.02
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POLR2J3-215ENST00000511313 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.66□□□□□ -1.02
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POLR2J3-215ENST00000511313 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.66□□□□□ -1.02
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POLR2J3-215ENST00000511313 OR2T7P0C7T2 308 aa8.65□□□□□ -1.02
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POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF681Q96N22 645 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.65□□□□□ -1.02
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POLR2J3-215ENST00000511313 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.65□□□□□ -1.02
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POLR2J3-215ENST00000511313 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.65□□□□□ -1.02
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POLR2J3-215ENST00000511313 MARVELD3Q96A59 401 aa8.65□□□□□ -1.03
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POLR2J3-215ENST00000511313 S100A14Q9HCY8 104 aa8.65□□□□□ -1.03
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POLR2J3-215ENST00000511313 OR5B21A6NL26 309 aa8.65□□□□□ -1.03
POLR2J3-215ENST00000511313 FADS1O60427 444 aa8.65□□□□□ -1.03
POLR2J3-215ENST00000511313 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
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POLR2J3-215ENST00000511313 SULT1C4O75897 302 aa8.65□□□□□ -1.03
POLR2J3-215ENST00000511313 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.65□□□□□ -1.03
POLR2J3-215ENST00000511313 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.65□□□□□ -1.03
POLR2J3-215ENST00000511313 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.65□□□□□ -1.03
POLR2J3-215ENST00000511313 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
POLR2J3-215ENST00000511313 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
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