RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 FAIMQ9NVQ4 179 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM38BQ9NVV0 291 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL21Q9UJP4 597 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SPEF1Q9Y4P9 236 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A096LPE4 126 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PPZ6 126 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC22A23A1A5C7 686 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 H3BN98 237 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 M0R1B8 84 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 TIPRLO75663 272 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 CD79AP11912 226 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 CD40P25942 277 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF83P51522 516 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 PLP2Q04941 152 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ZSCAN26Q16670 478 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 PHYHD1Q5SRE7 291 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC16A14Q7RTX9 510 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SYT9Q86SS6 491 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 STMN2Q93045 179 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 LURAP1Q96LR2 239 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 GPA33Q99795 319 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM204Q9BSN7 226 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 TSSK6Q9BXA6 273 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF121Q9H920 327 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 UNC79Q9P2D8 2635 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 FREM1Q5H8C1 2179 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 C12orf71A8MTZ7 269 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SOCS2O14508 198 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP1R3DO95685 299 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV3-15P01624 115 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 HMGN1P05114 100 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 OSMP13725 252 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 PRF1P14222 555 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 B4GALT1P15291 398 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF23P17027 643 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 BLVRAP53004 296 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ESRRGP62508 458 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 RUNX1T1Q06455 604 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC36A3Q495N2 470 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 THSD4Q6ZMP0 1018 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 LNX2Q8N448 690 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4F15Q8NGB8 312 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1J2Q8NGS2 313 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGTQ969N2 578 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 NELFAQ9H3P2 528 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC61A2Q9H9S3 476 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 VNN3Q9NY84 501 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 POU2F3Q9UKI9 436 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 RIIAD1A6NNX1 92 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC16A7O60669 478 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV1-44P01699 117 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 BMP4P12644 408 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 MSR1P21757 451 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 PAICSP22234 425 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 DNASE1P24855 282 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 LSM6P62312 80 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB1AP62820 205 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 MYBPC1Q00872 1141 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 GLO1Q04760 184 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 BSPH1Q075Z2 132 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 SGCAQ16586 387 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 MESTQ5EB52 335 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM27BQ5VT28 67 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC27A4Q6P1M0 643 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC22A25Q6T423 547 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 C22orf34Q6ZV56 151 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 GLB1L2Q8IW92 636 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf174Q8IYL3 243 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 PARP8Q8N3A8 854 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2T4Q8NH00 348 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 NSMAFQ92636 917 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXW5Q969U6 566 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 IL20RAQ9UHF4 553 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 ORC6Q9Y5N6 252 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 FKBP7Q9Y680 259 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 DPRXA6NFQ7 191 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 BHLHE40O14503 412 aa12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms