RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 NPTX1Q15818 432 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 KCNJ8Q15842 424 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC80Q76M96 950 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 KLBQ86Z14 1044 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 DECR2Q9NUI1 292 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 TREM2Q9NZC2 230 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 COL6A5A8TX70 2615 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 AKAP6Q13023 2319 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 NR5A2O00482 541 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 PHYHO14832 338 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 HPRP00739 348 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 PTNP21246 168 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 VSNL1P62760 191 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 PLP2Q04941 152 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 GALNTL6Q49A17 601 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 KRT74Q7RTS7 529 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 TSPEARQ8WU66 669 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ZBTB18Q99592 522 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ABCA1O95477 2261 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PPM1 405 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF726A6NNF4 738 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 M0R082 166 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 WNT9BO14905 357 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 GMFGO60234 142 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 FAM157BP0CG42 384 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 NR2F1P10589 423 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 GYS2P54840 703 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 SYPL1Q16563 259 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 SZRD1Q7Z422 152 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 SKA3Q8IX90 412 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 MREGQ8N565 214 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 CFHR4Q92496 578 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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PDE4D-210ENST00000503258 SLC22A4Q9H015 551 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF69Q9UC07 566 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PPW3 197 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ERICH4A6NGS2 130 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 FUT4P22083 530 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ALDH3B1P43353 468 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 RAD23AP54725 363 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 HIST1H3AP68431 136 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 CCNIQ14094 377 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF404Q494X3 552 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 ASB10Q8WXI3 467 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 HAVCR1Q96D42 359 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM178BH3BS89 294 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 PEX11AO75192 247 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 KNG1P01042 644 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 IGHG1P01857 330 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 RAC2P15153 192 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 APLNRP35414 380 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 CD200P41217 278 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEB1P43366 347 aa6.48□□□□□ -1.37
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