RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488403.5

NOP58-208, Transcript of NOP58 ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene NOP58, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP58-208	ENST00000488403	PTP4A3	O75365	173 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	CIB2	O75838	187 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	SEC14L2	O76054	403 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	CST1	P01037	141 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	FPR3	P25089	353 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	CD40	P25942	277 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	PCSK6	P29122	969 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	MYBPC1	Q00872	1141 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	FHL1	Q13642	323 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	NEUROG1	Q92886	237 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	MCHR2	Q969V1	340 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	RADIL	Q96JH8	1075 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	RBP7	Q96R05	134 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ALG12	Q9BV10	488 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	CD79A	P11912	226 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	B4GALT1	P15291	398 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	SLC6A6	P31641	620 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ERF	P50548	548 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ATP5J2	P56134	94 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	TUBA1B	P68363	451 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	TUBA4A	P68366	448 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	TSPAN31	Q12999	210 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	GK3P	Q14409	553 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	HIST3H3	Q16695	136 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	SLC22A25	Q6T423	547 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	TUBA1A	Q71U36	451 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF627	Q7L945	461 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	FANK1	Q8TC84	345 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF570	Q96NI8	536 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	KCNK17	Q96T54	332 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	GPA33	Q99795	319 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	NELFA	Q9H3P2	528 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403		U3KQV3	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	CAD	P27708	2225 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	PAX1	P15863	534 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	CBR1	P16152	277 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	SDHA	P31040	664 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	GSS	P48637	474 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	RPS6KA3	P51812	740 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	MICA	Q29983	383 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	THEM4	Q5T1C6	240 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF519	Q8TB69	540 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	NSMAF	Q92636	917 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403		Q96M85	177 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	VNN3	Q9NY84	501 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	HIVEP2	P31629	2446 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	AHCYL1	O43865	530 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	MGRN1	O60291	552 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	FKBP6	O75344	327 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	E2F6	O75461	281 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	UBL3	O95164	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	SLC2A10	O95528	541 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	HLA-H	P01893	362 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	SOD3	P08294	240 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ARR3	P36575	388 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	CDH11	P55287	796 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	NPRL3	Q12980	569 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	TNK1	Q13470	666 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	GSG1	Q2KHT4	349 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	RFX4	Q33E94	735 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	C10orf128	Q5T292	105 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NOP58-208	ENST00000488403	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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