RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 R3HDM4Q96D70 268 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PANX1Q96RD7 426 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A0A087X0M5 115 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GX30 115 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C4orf51C9J302 202 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C5orf58C9J3I9 102 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OIP5O43482 229 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SOX15O60248 233 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TIAF1O95411 115 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MT-ND4P03905 459 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 DRD5P21918 477 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TACR3P29371 465 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MTNR1BP49286 362 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PPT1P50897 306 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NHLH2Q02577 135 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RNF138Q8WVD3 245 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NEIL2Q969S2 332 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR1F2PQ96R84 312 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LYRM4Q9HD34 91 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PDE7BQ9NP56 450 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PRB8 838 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 K7ENP7 123 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 DLEU1O43261 78 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NXPH2O95156 264 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SPDEFO95238 335 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ADAP00813 363 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SFTPBP07988 381 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NUDT7P0C024 238 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 UBBP0CG47 229 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GDNFP39905 211 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 EFNA3P52797 238 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 UCNP55089 124 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MLC1Q15049 377 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 XKR6Q5GH73 641 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 DCAF12Q5T6F0 453 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TPRA1Q86W33 373 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SLC39A7Q92504 469 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MS4A8Q9BY19 250 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ASB6Q9NWX5 421 aa6.96□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RP1P56715 2156 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A0A0A6YYD5 115 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IRGMA1A4Y4 181 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 J3KTA2 159 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MANBAO00462 879 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 P2RX6O15547 441 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 AQP1P29972 269 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 WNT5AP41221 380 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 KIR3DL1P43629 444 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR1E2P47887 323 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CCR8P51685 355 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 BIKQ13323 160 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.95□□□□□ -1.3
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