RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NPR2P20594 1047 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MMP16P51512 607 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SIRPAP78324 504 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 FABP5Q01469 135 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GLO1Q04760 184 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RUNX1T1Q06455 604 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TOMM20Q15388 145 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SLC22A16Q86VW1 577 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF248Q8NDW4 579 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR52N5Q8NH56 324 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MCHR2Q969V1 340 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PNPLA2Q96AD5 504 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CENPOQ9BU64 300 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NUAK2Q9H093 628 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR51E2Q9H255 320 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 AMBNQ9NP70 447 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 KLHL1Q9NR64 748 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR14I1A6ND48 311 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NPIPA5E9PKD4 350 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GABRPO00591 440 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 XKRYO14609 159 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GNB5O14775 395 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SELENOFO60613 162 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 HLA-DQB1P01920 261 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ITGB2P05107 769 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 F13BP05160 661 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CST2P09228 141 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 COX5BP10606 129 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 IFNGR1P15260 489 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINB10P48595 397 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 DNASE1L1P49184 302 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CEP78Q5JTW2 689 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GPR137CQ8N3F9 429 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GPR148Q8TDV2 347 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NPIPA1Q9UND3 350 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM212A6NML5 194 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ENPP1P22413 925 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 THBS2P35442 1172 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MEOX1P50221 254 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MED22Q15528 200 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 C10orf35Q96D05 121 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 C4orf36Q96KX1 117 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 C5orf34Q96MH7 638 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GNRHR2Q96P88 292 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TIGARQ9NQ88 270 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SSR3Q9UNL2 185 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 VDAC3Q9Y277 283 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SULT2B1O00204 365 aa5.71□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CD8BP10966 210 aa5.71□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PAX7P23759 505 aa5.71□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.71□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF766Q5HY98 468 aa5.71□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 FAM27BQ5VT28 67 aa5.71□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.71□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 FAM166AQ6J272 317 aa5.71□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms