RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 MPP2Q14168 576 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 MOGQ16653 247 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 OR1J1Q8NGS3 322 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 OR6X1Q8NH79 312 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 GTF2H4Q92759 462 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 OR52B2Q96RD2 323 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 THAP1Q9NVV9 213 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 IGHG1P01857 330 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 OPN1SWP03999 348 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 HIST1H2ABP04908 130 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 QDPRP09417 244 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 BMP2P12643 396 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SLC6A2P23975 617 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 UCP2P55851 309 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SLC3A1Q07837 685 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 BAMBIQ13145 260 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 MIDNQ504T8 468 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SMYD1Q8NB12 490 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 MCHR1Q99705 422 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 NANSQ9NR45 359 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 OPN4Q9UHM6 478 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 CHP2O43745 196 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SERPINB7O75635 380 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SNAP29O95721 258 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV1-46P01743 117 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 PGA4P0DJD7 388 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 PGA3P0DJD8 388 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 PPIBP23284 216 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 MPV17P39210 176 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 ATP4BP51164 291 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF74Q16587 644 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 FAM209AQ5JX71 171 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 TREML4Q6UXN2 200 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 MAVSQ7Z434 540 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 C10orf111Q8N326 155 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SYT14Q8NB59 555 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 HIPK4Q8NE63 616 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF347Q96SE7 839 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PRG6 482 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM120BA0PK00 339 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 C5orf49A4QMS7 147 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 EVPLLA8MZ36 301 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 TPST2O60704 377 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 FOXH1O75593 365 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 MFN2O95140 757 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 FSHBP01225 129 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV3-13P01766 116 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 PRTN3P24158 256 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 STOMP27105 288 aa8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
DDX39B-211ENST00000449757 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms