RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP51Q70EK9 711 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUNDC1Q8IVP5 155 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIPK4Q8NE63 616 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4K5Q8NGD3 323 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NANPQ8TBE9 248 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf40Q8WZ69 217 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPDL1Q96EA4 605 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCHR1Q99705 422 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IKZF5Q9H5V7 419 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAP30LQ9HAJ7 183 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ESM1Q9NQ30 184 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R5Q9NYW4 299 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CORO2BQ9UQ03 480 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.21□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF13O43567 381 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFN2O95140 757 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTHP01270 115 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT-ND5P03915 603 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD52P43351 418 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UCP2P55851 309 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HFEQ30201 348 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRN1LQ496H8 165 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAGE3Q5JUK9 113 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPGNQ6UW88 154 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC22Q8N966 263 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMYD1Q8NB12 490 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1J2Q8NGS2 313 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMD4Q96H15 378 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGDIGQ99819 225 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NANSQ9NR45 359 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DECR2Q9NUI1 292 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNG2Q9Y698 323 aa11.2□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TANC2Q9HCD6 1990 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CH25HO95992 272 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHG1P01857 330 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 QDPRP09417 244 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPX2P18283 190 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRD4P21917 467 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GATA3P23771 443 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC18A1P54219 525 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLP2Q04941 152 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPTX1Q15818 432 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOGQ16653 247 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSTQ16762 297 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB1CQ92928 201 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELMOD3Q96FG2 381 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC167Q9P0B6 97 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF229Q9UJW7 825 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EVPLLA8MZ36 301 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS23O95084 383 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYPD3O95274 346 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSHBP01225 129 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-13P01766 116 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPN1SWP03999 348 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THY1P04216 161 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAKP20794 623 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APLNRP35414 380 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF81P51508 661 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF84P51523 738 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLRN1P58418 232 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM209AQ5JX71 171 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENTPD8Q5MY95 495 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR31Q5SQ13 230 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOXO1Q8NFA2 376 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6T1Q8NGN1 323 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCHR2Q969V1 340 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF347Q96SE7 839 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAL3ST1Q99999 423 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7orf69Q9H7B7 122 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPN4Q9UHM6 478 aa11.19□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMYA5Q8N3K9 4069 aa11.18□□□□□ -0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms