RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 EGFP01133 1207 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNA7P01567 189 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CD79AP11912 226 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP2P41181 271 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RABIFP47224 123 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CFHR1Q03591 330 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS2Q13268 280 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM122CQ6P4D5 195 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB13Q8WXK3 278 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2M4Q96R27 311 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF126Q9BV68 326 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM2Q9C040 744 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HIPK2Q9H2X6 1198 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM131Q92545 1883 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SPTA1P02549 2419 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MSGN1A6NI15 193 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EFSO43281 561 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A9P48067 706 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTA2P62736 377 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTG2P63267 376 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BTN3A2P78410 334 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EIPR1Q53HC9 387 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 VWA2Q5GFL6 755 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ALKAL2Q6UX46 152 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35F2Q8IXU6 374 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SIX5Q8N196 739 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP3Q92482 292 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2AT4A6NND4 320 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL5P13501 91 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SHEQ5VZ18 495 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ARSKQ6UWY0 536 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF321PQ8N8H1 164 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MSANTD3Q96H12 275 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF75AQ96N20 296 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX7Q9BT81 388 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 APMAPQ9HDC9 416 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM14DPA8MWL7 114 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MASP2O00187 686 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HEXAP06865 529 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A4P12235 298 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LAMP2P13473 410 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A6P31641 620 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNSP34059 522 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM50BP56557 158 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 B2MP61769 119 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRDL2Q6WN34 429 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR148Q8TDV2 347 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF128Q8TEB7 428 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IL23AQ9NPF7 189 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ING4Q9UNL4 249 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX46H3BTG2 121 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FADS1O60427 444 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A12O75746 678 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 POU3F4P49335 361 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK-25P63136 954 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RUNX3Q13761 415 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NFATC4Q14934 902 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MANEAQ5SRI9 462 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C3P1Q6ZMU1 363 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PLPP7Q8NBV4 271 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52E2Q8NGJ4 325 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2I1PQ8NGU4 316 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM86C2PA6NEL3 165 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SERINC4A6NH21 518 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6C76A6NM76 312 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SDHAP31040 664 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms