RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM3DQ96BQ1 224 aa1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIK3IP1Q96FE7 263 aa1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSNARE1Q96NA8 513 aa1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOX3Q9HBY0 568 aa1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1257Q9ULG3 409 aa1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCM1Q15154 2024 aa1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNTNAP1P78357 1384 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CARMIL3Q8ND23 1372 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM47DPA6NHR8 397 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 AIREO43918 545 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 UTS2O95399 124 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 AIFM1O95831 613 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf47O95873 294 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV2D-28P01615 120 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 FABP3P05413 133 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CT62P0C5K7 136 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF823P16415 610 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 HRH1P35367 487 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDKN1BP46527 198 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACLYP53396 1101 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTA2P62736 377 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTG2P63267 376 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTC1P68032 377 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCP10Q12799 353 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLAQ13239 276 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 PON3Q15166 354 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2SQ16763 222 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS26BQ4G0F5 336 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 VAX1Q5SQQ9 334 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 HES5Q5TA89 166 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGFL3Q6UXB1 125 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABHD13Q7L211 337 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 NIPA1Q7RTP0 329 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A9Q8IVM8 553 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 STPG2Q8N412 459 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM86B1Q8N7N1 296 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q8N976 141 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR10G2Q8NGC3 310 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR10G4Q8NGN3 311 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR1S2Q8NGQ3 325 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR10R2Q8NGX6 335 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2L8Q8NGY9 312 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4S2Q8NH73 311 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC2A14Q8TDB8 520 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCHPQ9BT92 498 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00597Q9H2U6 94 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC40A1Q9NP59 571 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 INPP5EQ9NRR6 644 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 PISDQ9UG56 409 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTNNA3Q9UI47 895 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ING4Q9UNL4 249 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRP4O75096 1905 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 HEATR9A2RTY3 570 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 XKRY2A2RUG3 117 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 WBP4O75554 376 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 GABARAPO95166 117 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX4O95219 450 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB3DO95716 219 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRYGBP07316 175 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPS2P11908 318 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOLR1P15328 257 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF43P17038 809 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFX3P48380 749 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSR4P51571 173 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00315P59091 139 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERCC8Q13216 396 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 GINS1Q14691 196 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM71E1Q6IPT2 247 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF836Q6ZNA1 936 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM92BQ6ZTR7 304 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDH26Q8IXH8 852 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIX1Q8N485 282 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASD2Q96D21 266 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC126Q96EE4 140 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERPINB12Q96P63 405 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2A5Q96R48 311 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLIN2Q99541 437 aa1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms