RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 MT-ND4LP03901 98 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 FURINP09958 794 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 FAM122BQ7Z309 247 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 RETREG3Q86VR2 466 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 CCSO14618 274 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 HS3ST1O14792 307 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PMS2P2O95744 297 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GJA4P35212 333 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SSX9Q7RTT3 188 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR51H1Q8NH63 302 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 DEGS1O15121 323 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 RRADP55042 308 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 UBE2G1P62253 170 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SEMA3BQ13214 749 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TAZQ16635 292 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 MARC2Q969Z3 335 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZNF583Q96ND8 569 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 CTRCQ99895 268 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OBP2AQ9NY56 170 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR5K3A6NET4 321 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 LURAP1Q96LR2 239 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PRR14Q9BWN1 585 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 MED9Q9NWA0 146 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 LRRC30A6NM36 301 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 DFFBO76075 338 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SRMP19623 302 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 MAP2K6P52564 334 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZNF534Q76KX8 674 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TVP23CQ96ET8 276 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 EMC7Q9NPA0 242 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 V9GYS6 101 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR5H15A6NDH6 313 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR5H14A6NHG9 310 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR5H1A6NKK0 313 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 CCL11P51671 97 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 KCTD11Q693B1 232 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 C14orf79Q96F83 325 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ATP1B1P05026 303 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GNB1P62873 340 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZNF626Q68DY1 528 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 Q6ZRG5 221 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 BANF2Q9H503 90 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 LANCL2Q9NS86 450 aa14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PPH5 198 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SLC16A6O15403 523 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 NDUFB7P17568 137 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GPR85P60893 370 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 YIF1AO95070 293 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 IGHV3-9P01782 118 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TRIM23P36406 574 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SLC35B4Q969S0 331 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 BTBD17A6NE02 478 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GCAP28676 217 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 RAB35Q15286 201 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TMUB2Q71RG4 321 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms