RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340369.3

XIRP1-201, Transcript of xin actin binding repeat containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene XIRP1, Length 6,460 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1-201ENST00000340369 NSA2O95478 260 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 BIDP55957 195 aa11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 RAP2BP61225 183 aa11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 MED25Q71SY5 747 aa11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 LINC00346Q8IVM7 164 aa11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 PGBD5Q8N414 524 aa11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 SLC39A9Q9NUM3 307 aa11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 FAM96BQ9Y3D0 163 aa11.61□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 LMO7DNF2Z398 122 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 BHLHE40O14503 412 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 SFTPCP11686 197 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 USP22Q9UPT9 525 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 KCNK2O95069 426 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 MAKP20794 623 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 GDNFP39905 211 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 RAB11AP62491 216 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CLINT1Q14677 625 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 MARCH3Q86UD3 253 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 LAX1Q8IWV1 398 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 KDM8Q8N371 416 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 NRIP3Q9NQ35 241 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CT45A6P0DMU7 189 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CT45A5P0DMU8 189 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CT45A7P0DMV0 189 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CT45A8P0DMV1 189 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CT45A9P0DMV2 189 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 FOLR1P15328 257 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CAPZBP47756 277 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 TESK1Q15569 626 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CT45A1Q5HYN5 189 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 METTL4Q8N3J2 472 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CT45A3Q8NHU0 189 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 DVL1O14640 695 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 APOA2P02652 100 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 DUSP2Q05923 314 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ACSM1Q08AH1 577 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 FCRL1Q96LA6 429 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 LHX6Q9UPM6 363 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 NXPH2O95156 264 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 EDDM3BP56851 147 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 HBG1P69891 147 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 HBG2P69892 147 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 Q6ZTK2 550 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 OVCH1Q7RTY7 1134 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.6□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 SERINC4A6NH21 518 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 B3GALT4O96024 378 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 OR10J4P0C629 311 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF728P0DKX0 622 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 SYT9Q86SS6 491 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 SLC43A2Q8N370 569 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 SLC46A1Q96NT5 459 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 NMNAT3Q96T66 252 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ADAM19Q9H013 955 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 HRO43593 1189 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 DEFA4P12838 97 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 GSK3AP49840 483 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 DAPP51397 102 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF766Q5HY98 468 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 MISPQ8IVT2 679 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 OR11G2Q8NGC1 345 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 LIPHQ8WWY8 451 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 LANCL2Q9NS86 450 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 CBR1P16152 277 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 GPR3P46089 330 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 GIPRP48546 466 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 MFAP5Q13361 173 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.59□□□□□ -0.55
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms