RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 PDZK1IP1Q13113 114 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 PDE7AQ13946 482 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 TRAM2Q15035 370 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SLC27A4Q6P1M0 643 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 TRIM40Q6P9F5 258 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 LRFN4Q6PJG9 635 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SLC16A9Q7RTY1 509 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 PIP4P1Q86T03 277 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 MARCH9Q86YJ5 346 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 TRIM48Q8IWZ4 208 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 OR4N4Q8N0Y3 316 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 C17orf78Q8N4C9 275 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 FADS6Q8N9I5 356 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 L3HYPDHQ96EM0 354 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 PPP3R2Q96LZ3 170 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 Q96MT0 163 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SLC46A1Q96NT5 459 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 S100A13Q99584 98 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 DUSP23Q9BVJ7 150 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SRMSQ9H3Y6 488 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 PLEKHA1Q9HB21 404 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 NECTIN3Q9NQS3 549 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 FTSJ1Q9UET6 329 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 A4GNTQ9UNA3 340 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 POMPQ9Y244 141 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 RASD1Q9Y272 281 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 MYRFQ9Y2G1 1151 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 PCNX3Q9H6A9 2034 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 PRORSD1PA6NEY8 169 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 MARCH11A6NNE9 402 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 MAGEB17A8MXT2 336 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 USP17L23D6RBM5 183 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 FCN1O00602 326 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 GFRA3O60609 400 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SNNO75324 88 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 ATP6AP2O75787 350 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 ZFPL1O95159 310 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 TSPAN19P0C672 248 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 CHRNB4P30926 498 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 PRDX2P32119 198 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 IDH2P48735 452 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 HTR6P50406 440 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 PDX1P52945 283 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 COPZ1P61923 177 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 FOXC1Q12948 553 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 GALEQ14376 348 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 PTGR1Q14914 329 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 GPR19Q15760 415 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SGCAQ16586 387 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 FAM214AQ32MH5 1076 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 GXYLT1Q4G148 440 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 TMEM35AQ53FP2 167 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 CLEC6AQ6EIG7 209 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SCIMPQ6UWF3 145 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 NRARPQ7Z6K4 114 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SYVN1Q86TM6 617 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 ANKRD46Q86W74 232 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 KLBQ86Z14 1044 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 FAM24BQ8N5W8 94 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 POC1AQ8NBT0 407 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 ABHD11Q8NFV4 315 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 OR4F6Q8NGB9 312 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 OR4K1Q8NGD4 311 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 OR8J2Q8NGG1 315 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 OR5D13Q8NGL4 314 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 OR6N2Q8NGY6 317 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SLC38A5Q8WUX1 472 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SMPDL3AQ92484 453 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SNAPC3Q92966 411 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 C10orf90Q96M02 699 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 DPYSL5Q9BPU6 564 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 MAGT1Q9H0U3 335 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SIRPDQ9H106 197 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 SLA2Q9H6Q3 261 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 FOLH1BQ9HBA9 442 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 ASCL3Q9NQ33 180 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 TUBG2Q9NRH3 451 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-201ENST00000334268 ASB6Q9NWX5 421 aa2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms