RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 OR13H1Q8NG92 308 aa15.67■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 HERVK_113Q902F9 699 aa15.67■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 MCHR2Q969V1 340 aa15.67■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 C4orf45Q96LM5 186 aa15.67■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 SLC19A3Q9BZV2 496 aa15.67■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 APMAPQ9HDC9 416 aa15.67■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.67■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 DOK2O60496 412 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 RNH1P13489 461 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 SKP2Q13309 424 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 C1orf61Q13536 156 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 C1QL3Q5VWW1 255 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM205Q6UW68 189 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 TAAR8Q969N4 342 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 RTN4RQ9BZR6 473 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 POFUT1Q9H488 388 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 MED9Q9NWA0 146 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 MED11Q9P086 117 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM212A6NML5 194 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 M0QYG6 137 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 WNT11O96014 354 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 PNPP00491 289 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 GUSBP08236 651 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 AKAIN1P0CW23 69 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 CSF2RBP32927 897 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 FAM74A1Q5RGS3 127 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 TMED4Q7Z7H5 227 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 PMEPA1Q969W9 287 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 FAM3DQ96BQ1 224 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 INTS14Q96SY0 518 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 MFFQ9GZY8 342 aa15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 C11orf98E9PRG8 122 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM127O75204 238 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 CLPSP04118 112 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 TNFRSF4P43489 277 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 OR52H1Q8NGJ2 320 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 FBXW5Q969U6 566 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 ELOVL3Q9HB03 270 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 LINC01565O15544 149 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 HLA-DQA2P01906 255 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 HPGDP15428 266 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 CALCRP30988 508 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 CENPAP49450 140 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF273Q14593 569 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 MEP1BQ16820 701 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 FNDC7Q5VTL7 733 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 STEAP1BQ6NZ63 245 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 CDH26Q8IXH8 852 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 PRR22Q8IZ63 422 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 B3GNT4Q9C0J1 378 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 FBXO4Q9UKT5 387 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4A-201ENST00000293683 KRBOX1C9JBD0 128 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ACHEP22303 614 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TACR3P29371 465 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MPGP29372 298 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PRSS3P35030 304 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 LY6G6FQ5SQ64 297 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MDGA2Q7Z553 956 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 OOSP2Q86WS3 158 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 NAXDQ8IW45 347 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 GALNT16Q8N428 558 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 DPYSL5Q9BPU6 564 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PBX4Q9BYU1 374 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TNFRSF10CO14798 259 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TSPAN9O75954 239 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PNMTP11086 282 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 LIPCP11150 499 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ICAM2P13598 275 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 APEHP13798 732 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 FUT7Q11130 342 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PDZD9Q8IXQ8 264 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.64■□□□□ 0.09
PDE4A-201ENST00000293683 LRP4O75096 1905 aa15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms