RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC20Q12834 499 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SFXN2Q96NB2 322 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF32Q9H0A6 362 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 FUOMA2VDF0 154 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMD9O00233 223 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 DVL2O14641 736 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 MPZL1O95297 269 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PTGS2P35354 604 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEA5P43359 124 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 USP43Q70EL4 1123 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SYS1Q8N2H4 156 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35F4A4IF30 521 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK2AP1O14519 115 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CLPXO76031 633 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PGA4P0DJD7 388 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PGA3P0DJD8 388 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ALOX5APP20292 161 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SCMH1Q96GD3 660 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 DACH2Q96NX9 599 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 AMELYQ99218 206 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TMED9Q9BVK6 235 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 POLHQ9Y253 713 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM166BA8MTA8 275 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC14L5O43304 696 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PLPP2O43688 288 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF43P17038 809 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ACTA2P62736 377 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ACTG2P63267 376 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBA1BP68363 451 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CAMK2DQ13557 499 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR50Q13585 617 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 MEP1BQ16820 701 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBA1AQ71U36 451 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX33Q8WV41 574 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 INTS14Q96SY0 518 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 GJE1A6NN92 205 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 INHBBP09529 407 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CRABP1P29762 137 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINB10P48595 397 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 MEOX1P50221 254 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFSF10P50591 281 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 RAC3P60763 192 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ARG2P78540 354 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 HSF2Q03933 536 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 C22orf42Q6IC83 251 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6X1Q8NH79 312 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 HPS1Q92902 700 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 GNG8Q9UK08 70 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SSR3Q9UNL2 185 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 WASF3Q9UPY6 502 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 RASD1Q9Y272 281 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 APC2O95996 2303 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD16AO95870 558 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC17A1Q14916 467 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 HIST3H3Q16695 136 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms