RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CXCL13O43927 109 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H3F3AP84243 136 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTF1Q16619 201 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR6V1Q8N148 313 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF843Q8N446 348 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR10D3Q8NH80 312 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR2V1Q8NHB1 315 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALG8Q9BVK2 526 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRXN1Q9BYN0 137 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RASD1Q9Y272 281 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC22A23A1A5C7 686 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF814B7Z6K7 855 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATE1O95260 518 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TFP02787 698 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TPOP07202 933 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EDN3P14138 238 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GALEQ14376 348 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCL2A1Q16548 175 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HBMQ6B0K9 141 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM225Q6GV28 225 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBTB46Q86UZ6 589 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC35F2Q8IXU6 374 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MEIOBQ8N635 442 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GATAD2BQ8WXI9 593 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBX5Q99593 518 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUAK2Q9H093 628 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCTN6O00399 190 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR2T7P0C7T2 308 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPN1P15169 458 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABOP16442 354 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CD79BP40259 229 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR2T27Q8NH04 317 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRDM14Q9GZV8 571 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MED29Q9NX70 200 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 B9D1Q9UPM9 204 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR14I1A6ND48 311 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM171A2A8MVW0 826 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AHCYL1O43865 530 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VAMP5O95183 116 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NR4A1P22736 598 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CENPAP49450 140 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CARD18P57730 90 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF85Q03923 595 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RUNX1T1Q06455 604 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACSM1Q08AH1 577 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSX1Q16384 188 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF585AQ6P3V2 769 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C3P1Q6ZMU1 363 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HDDC2Q7Z4H3 204 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CD163Q86VB7 1156 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TXNDC15Q96J42 360 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNK17Q96T54 332 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 B8ZZF3 427 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC22A1O15245 554 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SELENOFO60613 162 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPEP16870 476 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GADD45AP24522 165 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCSK6P29122 969 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRABP1P29762 137 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BLVRAP53004 296 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BIDP55957 195 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAC3P60763 192 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLE1Q04724 770 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC16A9Q7RTY1 509 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPAT4Q86UL3 456 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATCAYQ86WG3 371 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSC22D3Q99576 134 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AIREO43918 545 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC19A2O60779 497 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAMP1O60894 148 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF43P17038 809 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAPZA2P47755 286 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AQP6Q13520 282 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TPBGQ13641 420 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POU4F3Q15319 338 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGFBP7Q16270 282 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNM1P34Q6PK57 102 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LYPD4Q6UWN0 246 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF511Q8NB15 262 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM57AQ8TBR7 257 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UCN2Q96RP3 112 aa18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms