RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T7P0C7T2 308 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR2AP28223 471 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PYCR1P32322 319 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP5Q16690 384 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRG3Q86Y34 549 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T27Q8NH04 317 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PFN4Q8NHR9 129 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C15orf40Q8WUR7 153 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 STACQ99469 402 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf85Q9H1P6 137 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF25Q9UIL4 384 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SPACA6W5XKT8 324 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCD5O14737 125 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 BET1O15155 118 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 GPRIN2O60269 458 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGA3P26006 1051 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A6P31641 620 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ACVR1BP36896 505 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM34P42696 430 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PUDPQ08623 228 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR88Q6ZMY6 472 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC51BQ86UW2 128 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NRIP3Q9NQ35 241 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GUH1 482 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GVC2 190 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NIN4 97 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 TPPPO94811 219 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CCR9P51686 369 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 RRADP55042 308 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DHODHQ02127 395 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 STX4Q12846 297 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 GGTLC2Q14390 218 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK5R1Q15078 307 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 GSX2Q9BZM3 304 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM27Q9HBJ8 222 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf141Q9NUB4 165 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WV62 115 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CCR6P51684 374 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR68Q15743 365 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 AANATQ16613 207 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6V1Q8N148 313 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 SPICQ8N5J4 248 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 DTX3Q8N9I9 347 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMF1Q92530 271 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ENKD1Q9H0I2 346 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CEACAM4O75871 244 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GDNFP39905 211 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GDI2P50395 445 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD13AQ14CX5 517 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 DCST2Q5T1A1 773 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 THSD4Q6ZMP0 1018 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CDRT4Q8N9R6 151 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13C2Q8NGS9 318 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5J2Q8NH18 312 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GABARAPH6UMI1 98 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R233 179 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA16P05015 189 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CYC1P08574 325 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CPN1P15169 458 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 CRMP1Q14194 572 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 LSMEM1Q8N8F7 131 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF321PQ8N8H1 164 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF671Q8TAW3 534 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 LPAR4Q99677 370 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL3Q9UKT7 428 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-ND4P03905 459 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 PRB1P04280 392 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP1B1P05026 303 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKACBP22694 351 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRPAP78324 504 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T35Q8NGX2 323 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 RBP7Q96R05 134 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 HRKO00198 91 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 MPC2O95563 127 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-201ENST00000246533 NOS3P29474 1203 aa23.74■■□□□ 1.39
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