RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
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SPCS1-201ENST00000233025 NPTNQ9Y639 398 aa13.77□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 LYSTQ99698 3801 aa13.76□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 RAB36O95755 333 aa13.76□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV1-46P01743 117 aa13.76□□□□□ -0.21
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