RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	NHLH2	Q02577	135 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	LAT2	Q9GZY6	243 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A0U1RQF3	1178 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FFAR1	O14842	300 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	YY2	O15391	372 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CTSL	P07711	333 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ID2	Q02363	134 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	HAGH	Q16775	308 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MIDN	Q504T8	468 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CST9LP1	Q5W188	147 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF563	Q8TA94	476 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NEURL3	Q96EH8	262 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ETV7	Q9Y603	341 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ADRA2A	P08913	450 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ECH1	Q13011	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5I1	Q13606	314 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CCIN	Q13939	588 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895		Q499Y3	187 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	LEG1	Q6P5S2	330 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	VRK3	Q8IV63	474 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	DTD2	Q96FN9	168 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM169	Q96HH4	297 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CHST6	Q9GZX3	395 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895		H0YIV9	168 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NDUFS4	O43181	175 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC2A1	P11166	492 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	IRS1	P35568	1242 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CDK5	Q00535	292 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GLO1	Q04760	184 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM129C	Q86XR2	697 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC25A28	Q96A46	364 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SNX22	Q96L94	193 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TXN2	Q99757	166 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	METTL9	Q9H1A3	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CREBZF	Q9NS37	354 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR2T7	P0C7T2	308 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR2T27	Q8NH04	317 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GLYATL1	Q969I3	302 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GLTPD2	A6NH11	291 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	DBX1	A6NMT0	343 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	EMC8	O43402	210 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ASGR1	P07306	291 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	S1PR1	P21453	382 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PTTG1IP	P53801	180 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FOXO1	Q12778	655 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	HSD17B8	Q92506	261 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	THRSP	Q92748	146 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MIB2	Q96AX9	1013 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SMIM19	Q96E16	107 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	DOK5	Q9P104	306 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74

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