RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	RGMA	Q96B86	450 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061		Q9N2J8	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	ADAM20	O43506	726 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	GAS8	O95995	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	IFNA10	P01566	189 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	TYK2	P29597	1187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	MPV17	P39210	176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	GPX6	P59796	221 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	RAB1A	P62820	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC35B1	P78383	322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	TRADD	Q15628	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061		Q8N7P7	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A0A6YYD5	115 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CRCP	O75575	148 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR47	O94967	919 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	SERPINA5	P05154	406 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	OR8U9	P0C7N5	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CCL2	P13500	99 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	BMI1	P35226	326 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	KIR3DL2	P43630	455 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	RGS4	P49798	205 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	HAMP	P81172	84 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF117	Q03924	483 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	PLP2	Q04941	152 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	THEM4	Q5T1C6	240 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CD200R1	Q8TD46	325 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061		U3KQE9	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNH1	O95259	989 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	NGFR	P08138	427 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	MYBL1	P10243	752 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	P2RX1	P51575	399 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	LGALS4	P56470	323 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	H3F3A	P84243	136 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SNAP23-222	ENST00000626061	SEC23B	Q15437	767 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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