RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 BAHCC1Q9P281 2608 aa3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ATG2BQ96BY7 2078 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO10Q9HD67 2058 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0U1RQV5 110 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 EPOPA6NHQ4 379 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 H3BSA7 217 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 K7EQS6 105 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFRSF11BO00300 401 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SYT7O43581 403 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1F1O43749 312 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CYTIPO60759 359 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CLN5O75503 358 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 DIRAS1O95057 198 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ANGPTL1O95841 491 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OPN1SWP03999 348 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPIND1P05546 499 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SFTPBP07988 381 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ANXA8P13928 327 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 GNSP15586 552 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 DRD5P21918 477 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKACGP22612 351 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CRHBPP24387 322 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 DCKP27707 260 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 AQP1P29972 269 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 NTSP30990 170 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 RRM2P31350 389 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TSFMP43897 325 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OR3A3P47888 321 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 DAPP51397 102 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TMBIM6P55061 237 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MAZP56270 477 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDN17P56750 224 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CXCR4P61073 352 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CSNK1G2P78368 415 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK6Q00534 326 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SPIBQ01892 262 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 HSF2Q03933 536 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TGM3Q08188 693 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 LGALS3BPQ08380 585 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CD47Q08722 323 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 PMS2P3Q13401 168 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 FHL2Q14192 279 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OPCMLQ14982 345 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SPHARQ15513 63 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC5A12Q1EHB4 618 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 EOGTQ5NDL2 527 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 DCAF10Q5QP82 559 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SAXO2Q658L1 398 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4C11Q6IEV9 310 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 REEP3Q6NUK4 255 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 FAHD1Q6P587 224 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CEACAM20Q6UY09 585 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 COLCA1Q6ZS62 124 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF130Q86XS8 419 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MISPQ8IVT2 679 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 NAGSQ8N159 534 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFB123Q8N688 67 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC17Q8N6Y2 441 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM99Q8N816 258 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 FADS6Q8N9I5 356 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52N5Q8NH56 324 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 GIPC3Q8TF64 312 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MAL2Q969L2 176 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TM4SF18Q96CE8 201 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ISOC1Q96CN7 298 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 NEURL3Q96EH8 262 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.69□□□□□ -1.82
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