RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 SCAIQ8N9R8 606 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A28Q96A46 364 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 GPA33Q99795 319 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 PNPOQ9NVS9 261 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 POM121CA8CG34 1229 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 SDHDO14521 159 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 FOXH1O75593 365 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV1-46P01743 117 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 UCP2P55851 309 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 NCALDP61601 193 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM54Q969K7 222 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 SLC35B4Q969S0 331 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 EPYCQ99645 322 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 SLITRK2Q9H156 845 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 GLTPQ9NZD2 209 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 AUP1Q9Y679 476 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PLPP3O14495 311 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ADORA3P0DMS8 318 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 BGNP21810 368 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PCGF2P35227 344 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 MELKQ14680 651 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ULK3Q6PHR2 472 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PXKQ7Z7A4 578 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 BBS10Q8TAM1 723 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SELENONQ9NZV5 590 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 C5orf58C9J3I9 102 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 UBOX5O94941 541 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SNAP29O95721 258 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 GPANK1O95872 356 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-13P01766 116 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 CCNOP22674 350 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF154Q13106 437 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 MOGQ16653 247 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SPRNQ5BIV9 151 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 FAM209AQ5JX71 171 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SPATC1Q76KD6 591 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 OR6S1Q8NH40 331 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 MRI1Q9BV20 369 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 C1orf198Q9H425 327 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 NPHS2Q9NP85 383 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PPIAL4DF5H284 164 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 DHHO43323 396 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TPST1O60507 370 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 MFN2O95140 757 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 IL6P05231 212 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SBK2P0C263 348 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 EPHA3P29320 983 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PRKAR1BP31321 381 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 MPV17P39210 176 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SLC3A1Q07837 685 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms