RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 LCE6AA0A183 80 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 SURF4O15260 269 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 MGRN1O60291 552 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 MFN2O95140 757 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 CHEK2O96017 543 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 CD55P08174 381 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ADH4P08319 380 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 PATE4P0C8F1 98 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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SMAD3-211ENST00000559460 IL7RP16871 459 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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SMAD3-211ENST00000559460 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 PITPNBP48739 271 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 SERPINB9P50453 376 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 MMP15P51511 669 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMAD3-211ENST00000559460 EPS8Q12929 822 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 KIAA0040Q15053 153 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 SLC36A2Q495M3 483 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 GALNTL6Q49A17 601 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 CASC10Q5T4H9 136 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 LIPMQ5VYY2 423 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF627Q7L945 461 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM123Q8N131 208 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 HIPK4Q8NE63 616 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 CFHR4Q92496 578 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 DPF1Q92782 380 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ROPN1LQ96C74 230 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 LRR1Q96L50 414 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 C3orf30Q96M34 536 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 TBX15Q96SF7 602 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ARHGDIGQ99819 225 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMAD3-211ENST00000559460 MMP28Q9H239 520 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF224Q9NZL3 707 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMAD3-211ENST00000559460 THRBP10828 461 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 LAMP1P11279 417 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 EPHA3P29320 983 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 CFHR2P36980 270 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 MAGEA12P43365 314 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-211ENST00000559460 CFAP157Q5JU67 520 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 COX20Q5RI15 118 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 THEM4Q5T1C6 240 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-211ENST00000559460 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-211ENST00000559460 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 FITM2Q8N6M3 262 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 DTX3Q8N9I9 347 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-211ENST00000559460 STK35Q8TDR2 534 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ZG16BQ96DA0 208 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 SAMD8Q96LT4 415 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 EMC6Q9BV81 110 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 PPA2Q9H2U2 334 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 MSL2Q9HCI7 577 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 TBK1Q9UHD2 729 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0U1RQK1 487 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF879B4DU55 563 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 IFNL4K9M1U5 179 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 OR2T1O43869 369 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
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