RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-208	ENST00000558639	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	HBM	Q6B0K9	141 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF627	Q7L945	461 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	PROX1	Q92786	737 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM162A	Q96A26	154 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ARSG	Q96EG1	525 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	SNX18	Q96RF0	628 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	SDF2	Q99470	211 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	THTPA	Q9BU02	230 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	YY1AP1	Q9H869	796 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	SELENON	Q9NZV5	590 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ITPR3	Q14573	2671 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A087WZY1	265 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A0J9YW62	118 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A1W2PQD3	144 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	FXYD1	O00168	92 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	CXCR6	O00574	342 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	CLOCK	O15516	846 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	DSCAM	O60469	2012 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	PGM3	O95394	542 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	H6PD	O95479	791 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ITGA2	P17301	1181 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	MAP3K8	P41279	467 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	PCP4	P48539	62 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	PCYT1A	P49585	367 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	TSC22D1	Q15714	1073 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	GPR68	Q15743	365 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	GTDC1	Q4AE62	458 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	GGN	Q86UU5	652 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	DHFR2	Q86XF0	187 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF614	Q8N883	585 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	NFKBID	Q8NI38	313 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	RNF138	Q8WVD3	245 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	RAB8B	Q92930	207 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC35B4	Q969S0	331 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ASB9	Q96DX5	294 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM19	Q96HH6	336 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	NPAS1	Q99742	590 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	GLRX2	Q9NS18	164 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	MED17	Q9NVC6	651 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	NME4	O00746	187 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	KIAA0513	O60268	411 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ADA	P00813	363 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	CSTA	P01040	98 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	TFPT	P0C1Z6	253 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	NPIPA8	P0DM63	369 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	T-ENOL	P0DO92	83 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	UMPS	P11172	480 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	UBL4A	P11441	157 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	IL11	P20809	199 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	IL32	P24001	234 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	CCKAR	P32238	428 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	GSK3B	P49841	420 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	COPZ1	P61923	177 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	TNK1	Q13470	666 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	FLOT2	Q14254	428 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF141	Q15928	474 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35

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