RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	NIN	Q8N4C6	2090 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	VCAN	P13611	3396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	KNTC1	P50748	2209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ADAM10	O14672	748 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TMCC2	O75069	709 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	GLCE	O94923	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ACTL6A	O96019	429 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	IGHM	P01871	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	HPN	P05981	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	GLI4	P10075	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	SPI1	P17947	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	IL11	P20809	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ENPP1	P22413	925 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	SLC15A1	P46059	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TNFSF10	P50591	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	SLC25A1	P53007	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	CLRN1	P58418	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	RAC3	P60763	192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ACTA2	P62736	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ACTG2	P63267	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	HSF1	Q00613	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	RAB39A	Q14964	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	SPHAR	Q15513	63 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	MUL1	Q969V5	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	RASD2	Q96D21	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ARL5B	Q96KC2	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	MNT	Q99583	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	MED20	Q9H944	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	LAMA1	P25391	3075 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ATL1-208	ENST00000556067	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0G2JMM0	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PNV4	684 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PPB8	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PRS3	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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