RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553287.5

ATXN3-217, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-217ENST00000553287 CXCR2P25025 360 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 FNTAP49354 379 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 AP1B1Q10567 949 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 PTK6Q13882 451 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 DPYSL3Q14195 570 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 MESDQ14696 234 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SYCP1Q15431 976 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 DPYSL2Q16555 572 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ACKR1Q16570 336 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SLC5A12Q1EHB4 618 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 HKDC1Q2TB90 917 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 CCSMST1Q4G0I0 132 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 FILIP1LQ4L180 1135 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ODF2Q5BJF6 829 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 LDLRAP1Q5SW96 308 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SLC25A25Q6KCM7 469 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 PRSS41Q7RTY9 318 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 VSIG1Q86XK7 387 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF677Q86XU0 584 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 CLYBLQ8N0X4 340 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 PQLC3Q8N755 202 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 OR4K2Q8NGD2 314 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 OR13C4Q8NGS5 318 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 BRSK1Q8TDC3 778 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SSX3Q99909 188 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SELENOSQ9BQE4 189 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ASB8Q9H765 288 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 VNN3Q9NY84 501 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 DNPEPQ9ULA0 475 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SCN3AQ9NY46 2000 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 EML6Q6ZMW3 1958 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 NCKAP5O14513 1909 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 HIVEP2P31629 2446 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 OR51F1A6NGY5 319 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 USP27XA6NNY8 438 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 A8MUA0 341 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 DNAJB6O75190 326 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ANXA9O76027 345 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 AGTP01019 485 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 EPOP01588 193 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 C8orf89P0DMQ9 161 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 GDF1P27539 372 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SERPINB6P35237 376 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 MAGEB1P43366 347 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 RPL26P61254 145 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 DYNLT1P63172 113 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 PAX2Q02962 417 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 LRRC38Q5VT99 294 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF525Q8N782 197 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 IPMKQ8NFU5 416 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF671Q8TAW3 534 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 TSLPQ969D9 159 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ULK4Q96C45 1275 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 CABS1Q96KC9 395 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ACAT2Q9BWD1 397 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 PARVAQ9NVD7 372 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 CRLS1Q9UJA2 301 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 ASF1AQ9Y294 204 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 WIF1Q9Y5W5 379 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.29□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 MPDZO75970 2070 aa3.28□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 CCT8L1PA6NM43 557 aa3.28□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 IQCF5A8MTL0 148 aa3.28□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 H0YGG7 62 aa3.28□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 NDC80O14777 642 aa3.28□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 STX7O15400 261 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 NME2P1O60361 137 aa3.28□□□□□ -1.88
ATXN3-217ENST00000553287 SMPD2O60906 423 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms