RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 C1orf174Q8IYL3 243 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MIER2Q8N344 545 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PARP8Q8N3A8 854 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CLIP4Q8N3C7 705 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 KIR3DL3Q8N743 410 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC41A3Q96GZ6 507 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC30A2Q9BRI3 323 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 OR51B6Q9H340 312 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MMP26Q9NRE1 261 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SELENONQ9NZV5 590 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 A0A0G2JPF8 293 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SMIM23A6NLE4 172 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TM9SF1O15321 606 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SPRY3O43610 288 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MGRN1O60291 552 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 NDUFA7O95182 113 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 IGHV1-46P01743 117 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 BCHEP06276 602 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ADH4P08319 380 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SBK2P0C263 348 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HLA-DOBP13765 273 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CBLP22681 906 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CPT2P23786 658 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 APLNRP35414 380 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 RPL15P61313 204 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ERVS71-1P61550 626 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 GLO1Q04760 184 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ESCO2Q56NI9 601 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 COX20Q5RI15 118 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PXKQ7Z7A4 578 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 KIRREL3Q8IZU9 778 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 LSMEM1Q8N8F7 131 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 OR1J1Q8NGS3 322 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC19A3Q9BZV2 496 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 KLHL14Q9P2G3 628 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TRAPPC2LH3BP13 241 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ERLIN1O75477 346 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HPRP00739 348 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 IGHV2-70P01814 119 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PATE4P0C8F1 98 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CCL2P13500 99 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 AHCYP23526 432 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CRATP43155 626 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC6A9P48067 706 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 BPIFB3P59826 476 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 DSTNP60981 165 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PAX8Q06710 450 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TAF9Q16594 264 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 NRN1LQ496H8 165 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ALG10BQ5I7T1 473 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 FAM91A1Q658Y4 838 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 LRRN1Q6UXK5 716 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC16A14Q7RTX9 510 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TXNDC15Q96J42 360 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 RHOXF2Q9BQY4 288 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TXLNGYQ9BZA5 131 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 KCNN2Q9H2S1 579 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 NANOGQ9H9S0 305 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 A4GALTQ9NPC4 353 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 GLTPQ9NZD2 209 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 LRCH1Q9Y2L9 728 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 VWFP04275 2813 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC22A31A6NKX4 558 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SRRM5B3KS81 715 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 H3BSA7 217 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 RFXANKO14593 260 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 PLATP00750 562 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 CD55P08174 381 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MYZAPP0CAP1 466 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 LBPP18428 481 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MMP15P51511 669 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 NCALDP61601 193 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MAPK11Q15759 364 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 ULK3Q6PHR2 472 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 TMEM86BQ8N661 226 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 OR6X1Q8NH79 312 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 FGFBP3Q8TAT2 258 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-228ENST00000551473 SLC38A5Q8WUX1 472 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms