RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ATP1B1P05026 303 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ACHEP22303 614 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 OR1E2P47887 323 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ALG14Q96F25 216 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR2A5Q96R48 311 aa7.33□□□□□ -1.24
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