RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	BPTF	Q12830	3046 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	IDS	B3KWA1	339 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GFY	I3L273	518 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		J3QKU1	62 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF13	O43567	381 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAPPC3	O43617	180 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	AGT	P01019	485 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FOLR2	P14207	255 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMC3	P17980	439 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	COX5A	P20674	150 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PLP1	P60201	277 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	LMO4	P61968	165 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CXCL6	P80162	114 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TGIF1	Q15583	401 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	DUSP7	Q16829	419 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CARD16	Q5EG05	197 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CARD17	Q5XLA6	110 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PAQR7	Q86WK9	346 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MTURN	Q8N3F0	131 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR56B4	Q8NH76	319 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FGF13	Q92913	245 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FGF14	Q92915	247 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM15	Q9C019	465 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF302	Q9NR11	478 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NUDT15	Q9NV35	164 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MAST4	O15021	2626 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SPEG	Q15772	3267 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	EML5	Q05BV3	1969 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ITPR1	Q14643	2758 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A075B6Q4	140 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GU03	582 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		E7ESA3	106 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HSD17B6	O14756	317 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	DFNA5	O60443	496 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HCN1	O60741	890 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF254	O75437	659 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CTAG2	O75638	210 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CT62	P0C5K7	136 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF883	P0CG24	379 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GZMA	P12544	262 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TDGF1	P13385	188 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NPR2	P20594	1047 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CD1C	P29017	333 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OPRD1	P41143	372 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CRYBB2	P43320	205 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1G1	P47890	313 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SERTAD2	Q14140	314 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF77	Q15935	545 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	XKR7	Q5GH72	579 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM107	Q6UX40	140 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HAVCR1	Q96D42	359 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MBOAT7	Q96N66	472 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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