RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526715.5

ATG13-208, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-208	ENST00000526715	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	LRR1	Q96L50	414 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	CRLF2	Q9HC73	371 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	GPR35	Q9HC97	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	GLTP	Q9NZD2	209 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715		A6NIZ1	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	C16orf97	H3BN30	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	BHLHE40	O14503	412 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	IMPA2	O14732	288 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	ARPC3	O15145	178 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	ARHGEF9	O43307	516 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	SEC14L2	O76054	403 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	SLC2A10	O95528	541 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	OSM	P13725	252 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	IGFBP2	P18065	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	IL32	P24001	234 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	POU1F1	P28069	291 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	MPG	P29372	298 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	RAP1B	P61224	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	RAP1A	P62834	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	SORD	Q00796	357 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	S100PBP	Q96BU1	408 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG13-208	ENST00000526715	CIB4	A0PJX0	185 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	XKRY	O14609	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	TXNDC12	O95881	172 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	QDPR	P09417	244 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	NOS3	P29474	1203 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	PCYT1A	P49585	367 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	HIST3H3	Q16695	136 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	PGGHG	Q32M88	737 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	LNX2	Q8N448	690 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	OR4K13	Q8NH42	304 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	HTRA1	Q92743	480 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	MCHR2	Q969V1	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	ALG12	Q9BV10	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	LRRC42	Q9Y546	428 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715		A0A096LPE4	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715		A0A1W2PPZ6	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715		A0A1W2PR80	420 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	PRSS37	A4D1T9	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	DHH	O43323	396 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	EPHA2	P29317	976 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	STK11	Q15831	433 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	GABRA6	Q16445	453 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	TTC23	Q5W5X9	447 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	LEG1	Q6P5S2	330 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	ADCK1	Q86TW2	530 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	OR2T33	Q8NG76	320 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG13-208	ENST00000526715	NSMAF	Q92636	917 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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