RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 VLDLRP98155 873 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LIPEQ05469 1076 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF154Q13106 437 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 RLFQ13129 1914 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC153Q494R4 210 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 DNAL1Q4LDG9 190 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TP53I3Q53FA7 332 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC31Q6UY01 552 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SLC26A9Q7LBE3 791 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 PEX26Q7Z412 305 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SLC47A2Q86VL8 602 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 IQCKQ8N0W5 287 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SNX31Q8N9S9 440 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OR10V1Q8NGI7 309 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CNIH3Q8TBE1 160 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TOP1MTQ969P6 601 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHA8Q96JA3 519 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF521Q96K83 1311 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 REEP4Q9H6H4 257 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 B3GNT2Q9NY97 397 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 DCDC2Q9UHG0 476 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 PLXNB2O15031 1838 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1B0GTI1 187 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 EFCAB10A6NFE3 127 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 OR2AG2A6NM03 316 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PDZK1P1A8MUH7 402 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 BIRC5O15392 142 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 KDELR3O43731 214 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 EFNA2O43921 213 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ATP5LO75964 103 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 NSA2O95478 260 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINE2P07093 398 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 T-ENOLP0DO92 83 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PVRP15151 417 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 RAB4AP20338 218 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 M6PRP20645 277 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PTNP21246 168 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SPRP35270 261 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 DDOSTP39656 456 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ID1P41134 155 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 UQCRFS1P47985 274 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TGM4P49221 684 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 FBXW4P57775 412 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF33BQ06732 778 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 CALCOCO2Q13137 446 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 XRCC4Q13426 336 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 DPYSL3Q14195 570 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TGFBIQ15582 683 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 MOGQ16653 247 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 AKIRIN2Q53H80 203 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM135Q86UB9 458 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 AKAP14Q86UN6 197 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 KIF2BQ8N4N8 673 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 KBTBD8Q8NFY9 601 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 OR9G4Q8NGQ1 327 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TBCKQ8TEA7 893 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 FAM151AQ8WW52 585 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 NEUROG1Q92886 237 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TOMM40LQ969M1 308 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 NABP1Q96AH0 204 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF524Q96C55 264 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PSMB7Q99436 277 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 HCAR1Q9BXC0 346 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ANGPTL4Q9BY76 406 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRA2Q9H9E1 313 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TREM1Q9NP99 234 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ZFP57Q9NU63 452 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ABCD2Q9UBJ2 740 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 MGAT4AQ9UM21 535 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 ICAM5Q9UMF0 924 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PPIL1Q9Y3C6 166 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 L3MBTL1Q9Y468 752 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 VCANP13611 3396 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 TANC1Q9C0D5 1861 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 PARP14Q460N5 1801 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.84□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 AK9Q5TCS8 1911 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SMIM23A6NLE4 172 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINE3A8MV23 424 aa1.83□□□□□ -2.12
PDE4D-218ENST00000509368 K7EQG2 157 aa1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms