RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498530.5

PMPCB-208, Transcript of peptidase, mitochondrial processing beta subunit, human

TSL 2

Gene PMPCB, Length 1,161 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMPCB-208	ENST00000498530	KLK7	P49862	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	MS4A2	Q01362	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	DMTN	Q08495	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	NCF4	Q15080	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	STK38	Q15208	465 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	LIX1	Q8N485	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	NAT6	Q93015	286 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CWH43	Q9H720	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	RREB1	Q92766	1687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530		A0A0J9YWU9	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530		A0A1W2PRD5	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	KDELR3	O43731	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	MGRN1	O60291	552 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	RGR	P47804	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	BCL2L1	Q07817	233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	SPESP1	Q6UW49	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	LINC01565	O15544	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	TBL1X	O60907	577 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	FCN3	O75636	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	MB	P02144	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	FGG	P02679	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	TNFSF9	P41273	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530		Q6ZN92	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	RASL10A	Q92737	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PMPCB-208	ENST00000498530	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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