RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 TAC1P20366 129 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 DRD5P21918 477 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 DPP4P27487 766 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 GABRA3P34903 492 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 TIMP3P35625 211 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PEX19P40855 299 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PPICP45877 212 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 EMDP50402 254 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 SERPINB9P50453 376 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PNLIPRP2P54317 469 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 DIO3P55073 304 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 C2orf80Q0P641 193 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 SGCBQ16585 318 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 IMPG1Q17R60 797 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 UNC50Q53HI1 259 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 ENPP6Q6UWR7 440 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM107Q6UX40 140 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PAMR1Q6UXH9 720 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 NPSR1Q6W5P4 371 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF550Q7Z398 422 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC91Q7Z6B0 441 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 MARCH3Q86UD3 253 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 IFNEQ86WN2 208 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PTOV1Q86YD1 416 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PLCZ1Q86YW0 608 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM9CQ8IZT9 166 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 METTL4Q8N3J2 472 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC63Q8NA47 563 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 GATSQ8NAP1 163 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 OR7G2Q8NG99 324 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 TMCO6Q96DC7 493 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PIK3IP1Q96FE7 263 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CHMP6Q96FZ7 201 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF681Q96N22 645 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNA7Q96RP8 456 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 FMO2Q99518 471 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PIGQQ9BRB3 760 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 NTMT1Q9BV86 223 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 SFXN3Q9BWM7 321 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PINK1Q9BXM7 581 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PRRG4Q9BZD6 226 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 ACPTQ9BZG2 426 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 KLHL4Q9C0H6 718 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 UBQLN3Q9H347 655 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 DSN1Q9H410 356 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM185BQ9H7F4 350 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CALHM2Q9HA72 323 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 FOLH1BQ9HBA9 442 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 MID1IP1Q9NPA3 183 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 MIEF1Q9NQG6 463 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 FLRT3Q9NZU0 649 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM216Q9P0N5 145 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 VPS29Q9UBQ0 182 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PRODH2Q9UF12 536 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 TBK1Q9UHD2 729 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 GAB2Q9UQC2 676 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 TCF19Q9Y242 345 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CFL2Q9Y281 166 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 FIS1Q9Y3D6 152 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 SPTBP11277 2137 aa2.8□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A1W2PPR1 153 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 OR6C70A6NIJ9 312 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 A8MXE2 369 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CLOCKO15516 846 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGEF9O43307 516 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 GPR137BO60478 399 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 PLOD3O60568 738 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CDH16O75309 829 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 SEC22BO75396 215 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 RCBTB2O95199 551 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 SLU7O95391 586 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 UTS2O95399 124 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 LY6G6DO95868 133 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CGAP01215 116 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 H1F0P07305 194 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 TUBBP07437 444 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 RPS17P08708 135 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 RHOXF2BP0C7M4 288 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CFC1BP0CG36 223 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-211ENST00000492895 CFC1P0CG37 223 aa2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms