RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	ALG1L2	C9J202	215 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730		C9J4A7	227 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SCD	O00767	359 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	GLCE	O94923	617 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	IGF2	P01344	180 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	IFNG	P01579	166 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CD14	P08571	375 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	UCHL1	P09936	223 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2T7	P0C7T2	308 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PRKAR1A	P10644	381 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CD53	P19397	219 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	BTC	P35070	178 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PTGDS	P41222	190 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	HTR3A	P46098	478 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	FBXW4	P57775	412 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2B6	P58173	313 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SKP1	P63208	163 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SIRPA	P78324	504 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	RUNX1T1	Q06455	604 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PLA2G7	Q13093	441 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	BIK	Q13323	160 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	QPRT	Q15274	297 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	NSDHL	Q15738	373 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNJ8	Q15842	424 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	DDI2	Q5TDH0	399 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	HBM	Q6B0K9	141 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC20B	Q86Y33	519 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR6V1	Q8N148	313 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SYS1	Q8N2H4	156 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2T27	Q8NH04	317 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF519	Q8TB69	540 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SETD6	Q8TBK2	473 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM63	Q969Q1	353 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF170	Q96K19	258 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ABHD1	Q96SE0	405 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	COQ7	Q99807	217 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ALG12	Q9BV10	488 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR76	Q9H967	626 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TCFL5	Q9UL49	500 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	RASD1	Q9Y272	281 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	MED12	Q93074	2177 aa		5.22	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	KNTC1	P50748	2209 aa		5.21	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	FREM3	P0C091	2139 aa		5.21	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MEIOC	A2RUB1	952 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ACOD1	A6NK06	481 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	C21orf140	B9A014	251 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	C11orf98	E9PRG8	122 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MS4A18	H0YCH9	400 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MASP2	O00187	686 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	HCRTR2	O43614	444 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	IDH3B	O43837	385 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SUSD5	O60279	629 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TMCC2	O75069	709 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SERPINI2	O75830	405 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ONECUT2	O95948	504 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CD1A	P06126	327 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CELA2A	P08217	269 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CD63	P08962	238 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PNMT	P11086	282 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	HLA-DOB	P13765	273 aa		5.21	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms