RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	OAF	Q86UD1	273 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	NRM	Q8IXM6	262 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52J3	Q8NH60	311 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	LIPH	Q8WWY8	451 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2M2	Q96R28	347 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR35	Q9HC97	309 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		15.06	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ 0
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WUU8	490 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PR80	420 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	DHRS12	A0PJE2	317 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	GNGT2	O14610	69 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	MGRN1	O60291	552 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB35	Q15286	201 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	LINGO2	Q7L985	606 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP37	Q8NFH4	326 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCE1	Q9P212	2302 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	ZAN	Q9Y493	2812 aa		15.05	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF11B	O00300	401 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINI2	O75830	405 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	GK3P	Q14409	553 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	NELFA	Q9H3P2	528 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	REEP1	Q9H902	201 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	CRLF2	Q9HC73	371 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	INIP	Q9NRY2	104 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		15.04	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPBD1	B2RD01	187 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424		B9A039	149 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	PIP5K1C	O60331	668 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10H3	O60404	316 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL10	O95999	233 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A16	P16260	332 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	ACVR1B	P36896	505 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEA2	P43356	314 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	EFNA4	P52798	201 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	EFNB3	Q15768	340 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2T29	Q8NH02	315 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	CHID1	Q9BWS9	393 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	MOK	Q9UQ07	419 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		15.03	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35F4	A4IF30	521 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	HPR	P00739	348 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	CST1	P01037	141 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNGR1	P15260	489 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT6	P53370	316 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP2R2B	Q00005	443 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	NAAA	Q02083	359 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	SPOCK1	Q08629	439 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		15.02	■□□□□ -0

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