RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474929.1

USP54-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 4

Gene USP54, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-211ENST00000474929 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 IL17DQ8TAD2 202 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 MOAP1Q96BY2 351 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 APIPQ96GX9 242 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ARHGDIGQ99819 225 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ASCL2Q99929 193 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 IL19Q9UHD0 177 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 F2RL2O00254 374 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 CXCR1P25024 350 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 APLNRP35414 380 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 PGM1P36871 562 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 GATA4P43694 442 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 FNTAP49354 379 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 VEGFCP49767 419 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 P2RY4P51582 365 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ZNF404Q494X3 552 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 MTX3Q5HYI7 312 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 GRTP1Q5TC63 336 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 TTC27Q6P3X3 843 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 VRK2Q86Y07 508 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 PPCDCQ96CD2 204 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 OR51B6Q9H340 312 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 POLE3Q9NRF9 147 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 KPTNQ9Y664 436 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 A8MVM7 634 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 M0R3G1 203 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 AGR2O95994 175 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 GUSBP08236 651 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 RBP1P09455 135 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 SLC6A2P23975 617 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 TACR3P29371 465 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ERVS71-1P61550 626 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP54-211ENST00000474929 AANATQ16613 207 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 GSTA3Q16772 222 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 IMPG1Q17R60 797 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 SLC36A2Q495M3 483 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 TMEM123Q8N131 208 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 Q8N2B8 174 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 C10orf82Q8WW14 230 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 PHF21BQ96EK2 531 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 OXGR1Q96P68 337 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 GPR78Q96P69 363 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 TECTBQ96PL2 329 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 OR2M2Q96R28 347 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 SDF2Q99470 211 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 DDOQ99489 341 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 SIRPDQ9H106 197 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 SNX12Q9UMY4 172 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-211ENST00000474929 A0A1W2PRX2 142 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 C22orf46C9J442 243 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 H3BUX3 64 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 UGT2B17O75795 530 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 OR4F21O95013 312 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 KLHL2O95198 593 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 AHSA1O95433 338 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 TFPTP0C1Z6 253 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 CD83Q01151 205 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 ACSM1Q08AH1 577 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-211ENST00000474929 GNA13Q14344 377 aa6.58□□□□□ -1.36
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