RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473034.5

RNF25-204, Transcript of ring finger protein 25, human

TSL 2

Gene RNF25, Length 1,807 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF25-204	ENST00000473034	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ZNF721	Q8TF20	911 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	AMELY	Q99218	206 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SYT4	Q9H2B2	425 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CA10	Q9NS85	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MSRA	Q9UJ68	235 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TLCD2	A6NGC4	264 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ICOSLG	O75144	302 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PDGFA	P04085	211 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MAS1	P04201	325 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CSF2RB	P32927	897 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	DCAF7	P61962	342 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TSPAN5	P62079	268 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TOMM20	Q15388	145 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	WDR38	Q5JTN6	314 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TEX30	Q5JUR7	227 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	FAM166A	Q6J272	317 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	OR1F2P	Q96R84	312 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PDE7B	Q9NP56	450 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CIB4	A0PJX0	185 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034		H0YC42	278 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034		M0R233	179 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	T	O15178	435 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TSPAN2	O60636	221 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CTAG2	O75638	210 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	RBBP9	O75884	186 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	RRAS	P10301	218 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	C4BPB	P20851	252 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CENPA	P49450	140 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ROM1	Q03395	351 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SLC17A1	Q14916	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	OPCML	Q14982	345 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	POU4F3	Q15319	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ELOC	Q15369	112 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PIGK	Q92643	395 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ADO	Q96SZ5	270 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	GSX2	Q9BZM3	304 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	RAB33B	Q9H082	229 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CHRD	Q9H2X0	955 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ALG1L2	C9J202	215 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	NPIPB7	O75200	414 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TOX	O94900	526 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CSF1	P09603	554 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	GLUL	P15104	373 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CXCL2	P19875	107 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	LTBR	P36941	435 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	GFER	P55789	205 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	RAB30	Q15771	203 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SGCB	Q16585	318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	BIVM	Q86UB2	503 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CEP76	Q8TAP6	659 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	RNF128	Q8TEB7	428 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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