RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
SYNE4-204ENST00000465425 NPTNQ9Y639 398 aa16.58■□□□□ 0.25
SYNE4-204ENST00000465425 THADAQ6YHU6 1953 aa16.58■□□□□ 0.25
SYNE4-204ENST00000465425 TRIOO75962 3097 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 BGLAPP02818 100 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 CD27P26842 260 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 MNDAP41218 407 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 SELENOPP49908 381 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 SNTA1Q13424 505 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 Q6ZTK2 550 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 MEIOBQ8N635 442 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 THRSPQ92748 146 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 MVB12AQ96EY5 273 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 NUDT9Q9BW91 350 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 COPS7AQ9UBW8 275 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF69Q9UC07 566 aa16.58■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 GP1BBP13224 206 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 FAUP35544 74 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 BLVRAP53004 296 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 SCAND1P57086 179 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 EBPQ15125 230 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 NSDHLQ15738 373 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 LINC00303Q3SY05 128 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 ESCO2Q56NI9 601 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 C1QL3Q5VWW1 255 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 NLRC3Q7RTR2 1065 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 SIX5Q8N196 739 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 PRSS35Q8N3Z0 413 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 MSANTD3Q96H12 275 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 GLSO94925 669 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 OR6A2O95222 327 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 CBFBQ13951 182 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 C9orf40Q8IXQ3 194 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 C4orf45Q96LM5 186 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 CHIAQ9BZP6 476 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 ELOVL3Q9HB03 270 aa16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 C17orf51A8MQB3 221 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 LEUTXA8MZ59 168 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 ALG1L2C9J202 215 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 H0YC42 278 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 XRCC3O43542 346 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 SDC3O75056 442 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 RBBP9O75884 186 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 TPPPO94811 219 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 MT-ATP6P00846 226 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 IFNA7P01567 189 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 CCKBRP32239 447 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 RAD52P43351 418 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 MEP1BQ16820 701 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 WDR38Q5JTN6 314 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 PRSS58Q8IYP2 241 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 FTMTQ8N4E7 242 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 RADILQ96JH8 1075 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 AMELYQ99218 206 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 MGAT4CQ9UBM8 478 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PQD3 144 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 ACKR1Q16570 336 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 SGCBQ16585 318 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 C14orf28Q4W4Y0 310 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 VWA2Q5GFL6 755 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 SLC29A4Q7RTT9 530 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 GLB1L2Q8IW92 636 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 ANGPTL6Q8NI99 470 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 C17orf50Q8WW18 174 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 ASB17Q8WXJ9 295 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 RAB33BQ9H082 229 aa16.56■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PR77 199 aa16.55■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa16.55■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 PRSS37A4D1T9 235 aa16.55■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 CPN1P15169 458 aa16.55■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 TSPAN5P62079 268 aa16.55■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 HSD11B2P80365 405 aa16.55■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 CAMK2BQ13554 666 aa16.55■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 OTPQ5XKR4 325 aa16.55■□□□□ 0.24
SYNE4-204ENST00000465425 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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