RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463292.5

DMKN-223, Transcript of dermokine, human

TSL 1 (best)

Gene DMKN, Length 642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMKN-223	ENST00000463292	RYR3	Q15413	4870 aa		7.59	□□□□□ -1.19
DMKN-223	ENST00000463292	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
DMKN-223	ENST00000463292	TMEM247	A6NEH6	219 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SPRY3	O43610	288 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	NPIPB7	O75200	414 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	UBL3	O95164	117 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	NDUFA7	O95182	113 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	KRT75	O95678	551 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SERPINA5	P05154	406 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SBK2	P0C263	348 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	PATE4	P0C8F1	98 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	CCL2	P13500	99 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ZNF250	P15622	560 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	IL7R	P16871	459 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	DRD4	P21917	467 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	EPHA3	P29320	983 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	STX1B	P61266	288 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	COPZ1	P61923	177 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SLC3A1	Q07837	685 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	RBBP4	Q09028	425 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	CAMK2D	Q13557	499 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	GNA13	Q14344	377 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SYPL1	Q16563	259 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	RNF130	Q86XS8	419 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ZBTB9	Q96C00	473 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	CCDC115	Q96NT0	180 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	EMC6	Q9BV81	110 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	MARCH7	Q9H992	704 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	CDH20	Q9HBT6	801 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	MRGBP	Q9NV56	204 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	AIG1	Q9NVV5	245 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	RLIM	Q9NVW2	624 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	RNF114	Q9Y508	228 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	CCDC154	A6NI56	674 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SRRM5	B3KS81	715 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	HMGN4	O00479	90 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SDHD	O14521	159 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	RFXANK	O14593	260 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	UBOX5	O94941	541 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ANP32D	O95626	131 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	MT-ND5	P03915	603 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	CD80	P33681	288 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ZNF81	P51508	661 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	UFM1	P61960	85 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	FAM189A2	Q15884	450 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	MOG	Q16653	247 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	EPGN	Q6UW88	154 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ZNF627	Q7L945	461 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ANKRD46	Q86W74	232 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	MIER2	Q8N344	545 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ZNF519	Q8TB69	540 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	MRAP	Q8TCY5	172 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	STK35	Q8TDR2	534 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	NEURL3	Q96EH8	262 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	ITCH	Q96J02	903 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	FOXB1	Q99853	325 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DMKN-223	ENST00000463292	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		7.57	□□□□□ -1.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms