RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453553.1

USP25-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 3

Gene USP25, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-206ENST00000453553 C6orf223Q8N319 242 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 LRRC75AQ8NAA5 344 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 OR4A15Q8NGL6 344 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CXorf40AQ8TE69 158 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 HIST1H4GQ99525 98 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 RARRES2Q99969 163 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 HES7Q9BYE0 225 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 DYRK4Q9NR20 520 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 PIK3R4Q99570 1358 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FAM231BA6NCW3 169 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 HCRTR1O43613 425 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 HLA-HP01893 362 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 IFNW1P05000 195 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SERPINA5P05154 406 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CLTAP09496 248 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ACSM4P0C7M7 580 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CD151P48509 253 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SSR4P51571 173 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ACTA2P62736 377 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ACTG2P63267 376 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ACTC1P68032 377 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ACTA1P68133 377 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 STK38Q15208 465 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 PRR4Q16378 134 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 LIN9Q5TKA1 542 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 STUMQ69YW2 141 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SLC25A25Q6KCM7 469 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TTC23LQ6PF05 361 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 PRSS41Q7RTY9 318 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CMTM8Q8IZV2 173 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TMEM104Q8NE00 496 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF596Q8TC21 504 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 PIH1D2Q8WWB5 315 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 MYDGFQ969H8 173 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ECHDC3Q96DC8 303 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 OR5B12Q96R08 314 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 Q9H3A6 140 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 HRASLS2Q9NWW9 162 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 VNN3Q9NY84 501 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 KIF25Q9UIL4 384 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ING4Q9UNL4 249 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FRMPD3Q5JV73 1810 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TMEM120BA0PK00 339 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF879B4DU55 563 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 HAT1O14929 419 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 MGRN1O60291 552 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 LONP1P36776 959 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 GLP1RP43220 463 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 KIR2DS4P43632 304 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 OR3A4PP47883 348 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 NPBWR2P48146 333 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CLDN18P56856 261 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 TGFBR3Q03167 851 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ECH1Q13011 328 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 KIAA0040Q15053 153 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 Q3ZCU0 254 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 GPR107Q5VW38 600 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 H3F3CQ6NXT2 135 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 PRELID2Q8N945 189 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-206ENST00000453553 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms