RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGLEC5O15389 551 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CD3DP04234 171 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB40ALP0C0E4 278 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ST6GAL1P15907 406 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC37A1P57057 533 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ID2Q02363 134 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGLEC14Q08ET2 396 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PDGFRLQ15198 375 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4E2Q8NGC2 313 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51A2Q8NGJ7 313 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADIPOR1Q96A54 375 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PTX4Q96A99 478 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8B4Q96RC9 309 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BBS4Q96RK4 519 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CST11Q9H112 138 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 COA4Q9NYJ1 87 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF264O43296 627 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T1O43869 369 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 COL19A1Q14993 1142 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 COMMD7Q86VX2 200 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC30A7Q8NEW0 376 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PPA2Q9H2U2 334 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EPHA6Q9UF33 1036 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FITM1A5D6W6 292 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 J3QLW9 94 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DKK1O94907 266 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADH1CP00326 375 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CTLA4P16410 223 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF19P17023 458 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GUCA2AQ02747 115 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 APOOQ9BUR5 198 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A17Q9H1V8 727 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM72A0PK05 275 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EPOPA6NHQ4 379 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R233 179 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SSX5O60225 188 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C5AR1P21730 350 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP16P51512 607 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR68Q15743 365 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MICBQ29980 383 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A19Q695T7 634 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT74Q7RTS7 529 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5AS1Q8N127 324 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OTOSQ8NHW6 89 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MITD1Q8WV92 249 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGB4Q8WW32 186 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC41A2Q96JW4 573 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PLCE1Q9P212 2302 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA7Q8IZY2 2146 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.26□□□□□ -1.89
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PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV3-1P01715 115 aa3.26□□□□□ -1.89
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PGGT1B-203ENST00000419445 HES5Q5TA89 166 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINA12Q8IW75 414 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB5Q8WWX0 329 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 YPEL4Q96NS1 127 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC38A3Q99624 504 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51V1Q9H2C8 321 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 B9D1Q9UPM9 204 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ETV7Q9Y603 341 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 V9GY05 133 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR23AA6NEV1 266 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOT7O00154 380 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT2B1O00204 365 aa3.26□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DDAH2O95865 285 aa3.26□□□□□ -1.89
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