RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 MED28Q9H204 178 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 EMC7Q9NPA0 242 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR45Q9Y484 360 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ROBO3Q96MS0 1386 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 WIPF1O43516 503 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MT-ND4LP03901 98 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MAKP20794 623 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GNRHRP30968 328 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OTX2P32243 289 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF84P51523 738 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 F2RL1P55085 397 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 EGR4Q05215 589 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TDRG1Q3Y452 100 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2A2Q6IF42 318 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DLK2Q6UY11 383 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR92Q96MX6 357 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A4P31645 630 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 KDELR2P33947 212 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CASRP41180 1078 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN20P56880 219 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NTHL1P78549 312 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 METRNLQ641Q3 311 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 EPGNQ6UW88 154 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LCN9Q8WX39 176 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DYRK2Q92630 601 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MIB2Q96AX9 1013 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 IL22Q9GZX6 179 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HRH4Q9H3N8 390 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 USE1Q9NZ43 259 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MYOTQ9UBF9 498 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf72A6NCS6 295 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 H0Y980 276 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 K7ERU9 68 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DUX1O43812 170 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MMP23AO75900 390 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TGFB1P01137 390 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PDYNP01213 254 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PGA3P0DJD8 388 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MPZP25189 248 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CYB561P49447 251 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NUMBP49757 651 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB28P51157 221 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PCLAFQ15004 111 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP51A1Q16850 503 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DOK7Q18PE1 504 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 VMACQ2NL98 169 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SEZ6Q53EL9 994 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4A47Q6IF82 309 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM205Q6UW68 189 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 PIGXQ8TBF5 258 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 PSMG2Q969U7 264 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GALNT14Q96FL9 552 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DUX5Q96PT3 197 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 THSD1Q9NS62 852 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF358Q9NW07 568 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 A8MVM7 634 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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