RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 EMC6Q9BV81 110 aa21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ERVK13-1Q9NX77 482 aa21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 TAS2R16Q9NYV7 291 aa21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 EMC3Q9P0I2 261 aa21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 KLHL9Q9P2J3 617 aa21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 SPRR3Q9UBC9 169 aa21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF716A6NP11 495 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 GPR171O14626 319 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 LCKP06239 509 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ADRA2AP08913 450 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ETV1P50549 477 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 WNT4P56705 351 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 HSF2Q03933 536 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 SPHARQ15513 63 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 MED22Q15528 200 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 TIGD6Q17RP2 521 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC16A9Q7RTY1 509 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 SIAH3Q8IW03 269 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 SYT14Q8NB59 555 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 RNF128Q8TEB7 428 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 TMIGD2Q96BF3 282 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 WDYHV1Q96HA8 205 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 RERGLQ9H628 205 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 MARCH7Q9H992 704 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 PLSCR2Q9NRY7 297 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 CLEC2DQ9UHP7 191 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 DCTN6O00399 190 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 LIMS3P0CW19 117 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 LIMS4P0CW20 117 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 CTLA4P16410 223 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 GP2P55259 537 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 CAMK2DQ13557 499 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC35F2Q8IXU6 374 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ROBO4Q8WZ75 1007 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 PRRG4Q9BZD6 226 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 PRDM14Q9GZV8 571 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 LHX6Q9UPM6 363 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF175Q9Y473 711 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 FREM3P0C091 2139 aa21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 FCGR2AP12318 317 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ACTA2P62736 377 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ACTG2P63267 376 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 GALEQ14376 348 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNRF4Q8WWF5 429 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 TAAR6Q96RI8 345 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 INTS14Q96SY0 518 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 YIPF3Q9GZM5 350 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 RNF122Q9H9V4 155 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 CAMK2AQ9UQM7 478 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 OR14I1A6ND48 311 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 K7EM74 188 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 CSNK1A1P48729 337 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 HIST3H3Q16695 136 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 EGFL6Q8IUX8 553 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM45BQ96B21 275 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 OR2M2Q96R28 347 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ALG8Q9BVK2 526 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 ISYNA1Q9NPH2 558 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM171A2A8MVW0 826 aa21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 PHYHO14832 338 aa21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 NOL3O60936 208 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 HLA-DQA2P01906 255 aa21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 LHFPL3Q86UP9 236 aa21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 TIGD4Q8IY51 512 aa21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 MGLLQ99685 303 aa21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 ZFHX4Q86UP3 3567 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC160A6NGH7 325 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 TAF4O00268 1085 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 SELENOFO60613 162 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 HRGP04196 525 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM180AQ6UWF9 173 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 GLB1L2Q8IW92 636 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM123Q8N131 208 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 ZIC4Q8N9L1 334 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF511Q8NB15 262 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3-201ENST00000379215 OR6N1Q8NGY5 312 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms