RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379019.5

GPCPD1-201, Transcript of glycerophosphocholine phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPCPD1, Length 5,489 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1-201ENST00000379019 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 PRKAR1AP10644 381 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 SOX2P48431 317 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 CBFBQ13951 182 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ELP2Q6IA86 826 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 PRR19A6NJB7 356 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 H0YIZ8 118 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 TO15178 435 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 DUX1O43812 170 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ZP3P21754 424 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 CD276Q5ZPR3 534 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 EMC7Q9NPA0 242 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.64□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 IFNL4K9M1U5 179 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ACSM1Q08AH1 577 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 OR2L13Q8N349 312 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 NUBPLQ8TB37 319 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 LDAHQ9H6V9 325 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 POM121BA6NF01 834 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 M0QYG6 137 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 MPZL1O95297 269 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 CD3DP04234 171 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 SFTPCP11686 197 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 PVRP15151 417 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 HSD17B2P37059 387 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 SORDQ00796 357 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 GNA13Q14344 377 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 CBLN3Q6UW01 205 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ADCK2Q7Z695 626 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 UPK3AO75631 287 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 FOXC1Q12948 553 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ERV3-1Q14264 604 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 OR8S1Q8NH09 359 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 IFT46Q9NQC8 304 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 M0R233 179 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 PDCD5O14737 125 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 GIMD1P0DJR0 217 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 SPP1P10451 314 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ASMTP46597 345 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ZNF33BQ06732 778 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 MGAT2Q10469 447 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 MCHR1Q99705 422 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 SERPINI2O75830 405 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 DAOP14920 347 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 PNLIPRP2P54317 469 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 CLDN17P56750 224 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 TAS2R41P59536 307 aa6.63□□□□□ -1.35
GPCPD1-201ENST00000379019 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms